Główne kierunki działalności medycznej Uniwersyteckiego Szpitala Ortopedyczno - Rehabilitacyjnego w Zakopanem to:

W zakresie ortopedii dziecięcej:

• wrodzone i nabyte deformacje kręgosłupa,
• kompleksowe leczenie dzieci z mózgowym porażeniem dziecięcym,
• deformacje narządu ruchu u dzieci z przepukliną oponowo – rdzeniową,
• wrodzone i nabyte deformacje i skrócenia kończyn,
• profilaktyka i leczenie wad wrodzonych stawu biodrowego i stopy.

W zakresie ortopedii dorosłych:

• schorzenia nabyte i wrodzone, guzy i zniekształcenia pourazowe kręgosłupa szyjnego, piersiowego 
  i lędźwiowego,
• zmiany zwyrodnieniowe stawów biodrowych, kolanowych, skokowych,
• artroskopia stawów kolanowych, barkowych i skokowych,
• stymulatory przeciwbólowe w bólach chronicznych,
• diagnostyka, profilaktyka i leczenie osteoporozy.